ЭТИОЛОГИЯ ВНЕБОЛЬНИЧНЫХ ПНЕВМОНИЙ В ПЕРИОД ЭПИДЕМИЧЕСКОГО РАСПРОСТРАНЕНИЯ COVID-19 В РОСТОВСКОЙ ОБЛАСТИ

ПРЕПРИНТ

Эта статья является препринтом и не была отрецензирована.
О результатах, изложенных в препринтах, не следует сообщать в СМИ как о проверенной информации.

Попова А. Ю.,

Ежлова Е. Б.,

Демина Ю. В.,

Носков А. К.,

Ковалев Е. В.,

Карпущенко Г. В.,

Чемисова О. С.,

Пичурина Н. Л.,

Павлович Н. В.,

Водопьянов С. О.,

Гудуева Е. Н.,

Слись С. С.,

Пшеничная Н. Ю.,

Литовко А. Р.,

Асмолова Н. Ю.

2021-03-17

https://doi.org/10.21055/preprints-3111940

Введение. Пандемия COVID-19 в 2020 году внесла свой вклад в эпидемиологию респираторных инфекций. Важным является своевременное проведение дифференциальной диагностики COVID-19 и сезонных острых респираторных заболеваний. У пациентов с новой коронавирусной инфекцией возрастает риск развития госпитальной пневмонии. Актуальным является анализ особенностей циркуляции резистентных к антибактериальным химиопрепаратам штаммов возбудителей внутрибольничных инфекций. Цель – изучение этиологической структуры внебольничных пневмоний в период эпидемического распространения COVID-19, оценка рисков присоединения возбудителей пневмоний, связанных с оказанием медицинской помощи. Материалы и методы: Исследовали биологический материал от 446 пациентов с диагнозом «внебольничная пневмония», находившихся на амбулаторном лечении или в стационарах г. Ростова-на-Дону. Верификация респираторных вирусов, включая РНК SARS-CoV-2, а также M. pneumoniae, C. pneumoniae, L. pneumophila выполнена методом полимеразной цепной реакции в мазках носоглотки. Бактериологический анализ мокроты проводили с использованием дифференциально-диагностических сред, идентификацию выделенных патогенов осуществляли с помощью времяпролетной масс-спектрометрии на приборе Autoflex (Bruker Daltonics) c программным обеспечением BioTyper 3,0. Результаты и обсуждение. В период распространения новой коронавирусной инфекции в Ростовской области доля положительных результатов на SARS-CoV-2 среди пациентов с диагнозом внебольничная пневмония составляет 35,6 %. Частота микстинфекций вирусной природы достоверно не отличалась среди пациентов с лабораторно подтвержденным диагнозом COVID-19 и пациентов с отрицательным результатом на SARS-CoV-2 (25,9 % и 26,2 %, соответственно). В структуре микробиоты превалировали грибы рода Candida и плазмокоагулирущие стафилококки. Достоверно чаще от пациентов с лабораторно подтвержденным COVID-19 изолировали культуры неферментирующих грамотрицательных бактерий. У 51,6% пациентов, проходивших лечение в стационаре, отмечено вторичное коинфицирование, вероятно связанное с объектами внешней среды или с передачей инфекции от персонала. Передача ИСМП между пациентами не установлена.

Ссылка для цитирования:

Попова А. Ю., Ежлова Е. Б., Демина Ю. В., Носков А. К., Ковалев Е. В., Карпущенко Г. В., Чемисова О. С., Пичурина Н. Л., Павлович Н. В., Водопьянов С. О., Гудуева Е. Н., Слись С. С., Пшеничная Н. Ю., Литовко А. Р., Асмолова Н. Ю. 2021. ЭТИОЛОГИЯ ВНЕБОЛЬНИЧНЫХ ПНЕВМОНИЙ В ПЕРИОД ЭПИДЕМИЧЕСКОГО РАСПРОСТРАНЕНИЯ COVID-19 В РОСТОВСКОЙ ОБЛАСТИ. COVID19-PREPRINTS.MICROBE.RU. https://doi.org/10.21055/preprints-3111940

Список литературы

1. О состоянии санитарно-эпидемиологического благополучия населения в Российской Федерации в 2019 году: Государственный доклад. – М.: Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, 2020. 299 с.

2. Arentz M., Yim E., Klaff L., et al. Characteristics and outcomes of 21 critically ill patients with COVID-19 in Washington State // J. Am Med. Assoc. 2020. Vol. 19. pp. E1-E3.

3. Lai C.C, Wang C.Y, Hsueh P.R. Co-infections among patients with COVID-19: The need for combination therapy with non-anti-SARS-CoV-2 agents? // J. Microbiol. Immunol. Infect. 2020. Vol. 53(4). pp. 505-512.

4. Wu C., Chen X., Cai Y., Xia J., Zhou X., Xu S. Risk factors associated with acute respiratory distress syndrome and death in patients with coronavirus disease 2019 pneumonia in Wuhan, China. // JAMA Intern. Med. 2020. Vol. 13. pp. 934-943.

5. Zhou F., Yu T., Du R., et al. Clinical course and risk factors for mortality of adult inpatients with COVID-19 in Wuhan, China: a retrospective cohort study. // Lancet. 2020. Vol. 395. pp. 1054–1062.

6. Loosli C.G., Stinson S.F., Ryan D.P., et al. The destruction of type 2 pneumocytes by airborne influenza PR8-A virus; its effect on surfactant and lecithin content of the pneumonic lesions of mice. // Chest. 1975. Vol. 67. pp. 7S–14S.

7. McCullers J.A. The co-pathogenesis of influenza viruses with bacteria in the lung. // Nat. Rev. Microbiol. 2014. Vol. 12(4). pp. 252-62.

8. Попова А.Ю., Ежлова Е.Б., Демина Ю.В., и др. Особенности этиологии внебольничных пневмоний, ассоциированных с COVID-19. // Проблемы особо опасных инфекций. 2020. № 4. С. 99-105.

9. Memish Z.A, Perlman S, Van Kerkhove M.D, et al. Middle East respiratory syndrome. // Lancet. 2020. Vol. 395. pp. 1063–1077.

10. Li J., Wang J., Yang Y., et al. Etiology and antimicrobial resistance of secondary bacterial infections in patients hospitalized with COVID-19 in Wuhan, China: a retrospective analysis. // Antimicrobial Resistance & Infection Control. 2020. Vol. 9(1). pp. 1-7.

11. Селькова Е.П., Гренкова Т.А., Гудова Н.В.,и др. Итоги эпидсезона 2017/18 гг. по гриппу и острой респираторной вирусной инфекции. Особенности этиотропной терапии. РМЖ. // Медицинское обозрение. 2018. № 11. С. 49-53.

12. Uphoff H., Cohen J.M., Fleming D., et al. Harmonisation of national influenza surveillance morbidity data from EISS: a simple index. // Euro Surveill. 2003. Vol. 8(7). pp. 156–64.

ПРЕПРИНТ

ИНФОРМАЦИЯ О ПРЕПРИНТЕ