Внебольничные пневмонии бактериальной этиологии и спектр чувствительности возбудителей к антибиотикам у коронапозитивных и коронанегативных больных

ПРЕПРИНТ

Эта статья является препринтом и не была отрецензирована.
О результатах, изложенных в препринтах, не следует сообщать в СМИ как о проверенной информации.

Павлович Н. В.,

Цимбалистова М. В.,

Аронова Н. В.,

Анисимова А. С.,

Водопьянов С. О.,

Водопьянов А. С.,

Гудуева Е. Н.,

Сагакянц М. М.,

Ковалев Е. В.,

Носков А. К.

2021-03-09

https://doi.org/10.21055/preprints-3111937

Актуальность. В условиях продолжающейся пандемии коронавирусной инфекции на фоне снижения иммунного статуса организма течение вирусной пневмонии достаточно часто осложняется присоединением бактериальной микрофлоры. Возбудители такой коинфекции могут проявлять множественную лекарственную резистентность, что существенно снижает эффективность этиотропной терапии. В этой связи целесообразным представляется микробиологическое сопровождение пациентов с целью выбора наиболее оптимальных схем лечения. Цель. Изучение видового состава бактериальных возбудителей внебольничных пневмоний (ВП) у коронапозитивных (Covid-19 +) и коронанегативных (Covid-19 -) пациентов и определение спектра их чувствительности/устойчивости к антибактериальным препаратам. Материал и методы. Исследован видовой состав микроорганизмов образцов мокроты от 723 пациентов с ВП, поступивших из ЛПО г. Ростова-на-Дону в августе и декабре 2020 года. Идентификацию выделенных культур проводили с помощью бактериологического и масс-спектрометрического методов. Чувствительность бактерий к антибиотикам определяли диско-диффузионным методом. Результаты. Показано, что в августе в спектре возбудителей ВП превалировали пневмококки и стафилококки, тогда как в декабре вырос процент выделений Acinetobacter spp. и S. haemolyticus. Обнаружена высокая степень изоляции различных видов дрожжей р. Candida, причем у Cov+ больных выявлена тенденция к большей обсемененности (≥104 м.кл./мл). Некоторые возбудители (A. baumannii, S. haemolyticus, P. aeruginosa, S. maltophilia) характеризуются полиантибиотикорезистентностью, а отдельные штаммы этих видов – панрезистентностью ко всем группам антибиотиков. Заключение. Полученные данные демонстрируют, что тяжелые формы внебольничной пневмонии могут быть обусловлены вирусо-бактериальными и вирусо-бактериально-дрожжевыми ассоциациями возбудителей, включая бактерии с узким спектром чувствительности к антибактериальным препаратам.

Ссылка для цитирования:

Павлович Н. В., Цимбалистова М. В., Аронова Н. В., Анисимова А. С., Водопьянов С. О., Водопьянов А. С., Гудуева Е. Н., Сагакянц М. М., Ковалев Е. В., Носков А. К. 2021. Внебольничные пневмонии бактериальной этиологии и спектр чувствительности возбудителей к антибиотикам у коронапозитивных и коронанегативных больных. COVID19-PREPRINTS.MICROBE.RU. https://doi.org/10.21055/preprints-3111937

Список литературы

1. Зайцев А.А., Синопальников А.И. «Трудная» пневмония. М.; 2020. / Zaitsev AA, Sinopal'nikov AI «Trudnaya» pnevmoniya. M.; 2020. [in Russian]

2. Голубкова А.А., Платонова Т.А., Скляр М.С., Воробьев А.В., Макарочкина Н.Г., Карбовничая Е.А., и др. Структурный анализ заболеваемости COVID-19 персонала крупного многопрофильного медицинского центра. Сборник тезисов VIII Конгресса с международным участием «Контроль и профилактика инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи (ИСМП-2020)»; Ноябрь 25-27, 2020; Москва / под ред. академика РАН В.Г. Акимкина. - М.: ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, 2020. - С. 29-30. / Golubkova AA, Platonova TA, Sklyar MS, Vorob'ev AV, Makarochkina NG, Karbovnichaya EA, et al. Strukturnyi analiz zabolevaemosti COVID-19 personala krupnogo mnogoprofil'nogo meditsinskogo tsentra. Sbornik tezisov VIII Kongressa s mezhdunarodnym uchastiem «Kontrol' i profilaktika infektsii, svyazannykh s okazaniem meditsinskoi pomoshchi (ISMP-2020)»; Noyabr' 25-27, 2020; Moskva / pod red. akademika RAN VG Akimkina. - M.: FBUN TsNII Epidemiologii Rospotrebnadzora, 2020;29-30. [in Russian]

3. Tay MZ, Poh CM, Rénia L, MacAry PA, Ng LFP. The trinity of COVID-19: immunity, inflammation and intervention. Nat. Rev. Immunol. 2020; 20: 363-374. DOI: 10.1038/s41577-020-0311-8

4. Chen N, Zhou M, Dong X, Qu J, Gong F, Han Y, et al. Epidemiological and clinical characteristics of 99 cases of 2019 novel coronavirus pneumonia in Wuhan, China: a descriptive study. Lancet. 2020; 395: 507-513. DOI: 10.1016/S0140-6736(20)30211-7

5. Arastehfar A, Carvalho A, van de Veerdonk FL, Je_rey D Jenks, Koehler P, Krause R, et al. COVID-19 Associated Pulmonary Aspergillosis (CAPA) - from immunology to treatment. J. Fungi. 2020; 6(2): 91. DOI: 10.3390/jof6020091

6. Chatterjee M, Anju CP, Biswas L, Kumar VA, Mohan CG, Biswas R. Antibiotic resistance in Pseudomonas aeruginosa and alternative therapeutic options. Int. J. Med. Microbiol. 2016; 306(1): 48-58. DOI: 10.1016/j.ijmm.2015.11.004

7. Бондаренко А.П., Шмыленко В.А., Троценко О.Е., Котова В.О., Бутакова Л.В., Базыкина Е.А. Характеристика бактериальной микрофлоры, выделенной из проб мокроты больных пневмонией в Хабаровске и Хабаровском крае в начальный период пандемии Covid-19 (май-июнь 2020 г.). Проблемы ООИ. – 2020. - № 3. – С. 43-49. DOI: 10.21055/0370-1069-2020-3-43-49. /Bondarenko AP, Shmylenko VA, Trotsenko OE, Kotova VO, Butakova LV, Bazykina EA. Characteristics of Bacterial Microflora Isolated from Sputum of Patients with Pneumonia Registered in Khabarovsk City and Khabarovsk Territory in the Initial Period of COVID-19 Pandemic in May–June, 2020. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2020;(3):43-49. [in Russian] DOI: 10.21055/0370-1069-2020-3-43-49

8. Попова А.Ю., Ежлова Е.Б., Демина Ю.В., Носков А.К., Ковалев Е.В., Чемисова О.С., и др. Особенности этиологии внебольничных пневмоний, ассоциированных с COVID-19. Проблемы ООИ. – 2020. - № 4. – С. 99-105. DOI: 10.21055/0370-1069-2020-4-99-105. /Popova AY, Ezhlova EB, Demina YV, Noskov AK, Kovalev EV, Chemisova OS, et al. Features of Etiology of Community-Acquired Pneumonia Associated with COVID-19. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2020;(4):99-105. [in Russian] DOI: 10.21055/0370-1069-2020-4-99-105

9. Aitken SL, Clancy CJ. Guidance on the treatment of antimicrobial resistant gram-negative infections. Contagion. 2020; 5(6): 22-23.

10. Lee C-R, Cho H, Jeong BC, Lee CH. Strategies to minimize antibiotic resistance. Int. J. Environ. Res. Public Health. 2013; 10 (9): 4274-4305. DOI: 10.3390/ijerph10094274

11. Зайцев А.А. Внебольничная пневмония: возможности диагностики, лечения и вакцинопрофилактики в условиях пандемии COVID-19. Практическая пульмонология. – 2020. - № 1. – С. 14-21. / Zaitsev AA Vnebol'nichnaya pnevmoniya: vozmozhnosti diagnostiki, lecheniya i vaktsinoprofilaktiki v usloviyakh pandemii COVID-19. Prakticheskaya pul'monologiya. 2020; 1: 14-21. [in Russian]

12. Sattar SBA, Sharma S. Bacterial Pneumonia. 2020. In: StatPearls [Internet]. Treasure Island (FL): StatPearls Publishing; 2020. Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK513321/

13. Лабораторная диагностика внебольничных пневмоний: Методические указания МУК  4.2.3115-13. М. 2013. / Laboratornaya diagnostika vnebol'nichnykh pnevmonii: Metodicheskie ukazaniya MUK  4.2.3115-13. M. 2013. [in Russian]

14. Лабораторная диагностика внебольничной пневмонии пневмококковой этиологии: Методические рекомендации МР 4.2.0114-16. М. 2016. / Laboratornaya diagnostika vnebol'nichnoi pnevmonii pnevmokokkovoi etiologii: Metodicheskie rekomendatsii MR 4.2.0114-16. M. 2016. [in Russian]

15. Клинические рекомендации МЗ РФ. Кистозный фиброз (муковисцидоз): микробиологическая диагностика хронической респираторной инфекции, 2018. / Klinicheskie rekomendatsii MZ RF. Kistoznyi fibroz (mukovistsidoz): mikrobiologicheskaya diagnostika khronicheskoi respiratornoi infektsii, 2018. [in Russian]

16. Нозокомиальная пневмония у взрослых: Российские национальные рекомендации / Под ред. акад. РАН Б.Р. Гельфанда; отв. ред. к.м.н., доцент Д.Н. Проценко, к.м.н., доцент Б.З. Белоцерковский. — 2-е изд., перераб. и доп. — М.: ООО «Издательство «Медицинское информационное агентство», 2016. / Nozokomial'naya pnevmoniya u vzroslykh: Rossiiskie natsional'nye rekomendatsii / Pod red. akad. RAN BR Gel'fanda; otv. red. k.m.n., dotsent DN Protsenko, k.m.n., dotsent BZ Belotserkovskii. — 2-e izd., pererab. i dop. M.: OOO «Izdatel'stvo «Meditsinskoe informatsionnoe agentstvo», 2016. [in Russian]

17. Мороз А.Ф., Снегирёва А.Е. Грибы рода Candida (Методы выделения, идентификации на видовом уровне и определение чувствительности к противогрибковым препаратам) // Методические рекомендации. – М.: НИИЭМ им. Н.Ф. Гамалеи РАМН, 2009. / Moroz AF, Snegireva AE Griby roda Candida (Metody vydeleniya, identifikatsii na vidovom urovne i opredelenie chuvstvitel'nosti k protivogribkovym preparatam). Metodicheskie rekomendatsii. M.: NIIEM im. N.F. Gamalei RAMN, 2009. [in Russian]

18. Определение чувствительности микроорганизмов к антибактериальным препаратам: Методические указания МУК 4.2.1890-04. М. 2004. /Opredelenie chuvstvitel'nosti mikroorganizmov k antibakterial'nym preparatam: Metodicheskie ukazaniya MUK 4.2.1890-04. M. 2004. [in Russian]

ПРЕПРИНТ

ИНФОРМАЦИЯ О ПРЕПРИНТЕ